تشكل شعبه الشؤون الماليه في كلية العلوم الاسلامية أحد اهم مرافق هذه الكلية كونها تعنى بمجمل الشؤون المالية الخاصة بالكلية من خلال التنسيق مع ديوان الجامعة في مايتعلق بتوفير سائر احتياجات الكلية من خلال انجاز معاملات المشتريات ، تنظيم السجلات المعتمدة وانجاز قوائم الرواتب الشهرية لرواتب المنتسبين,والايفادات,والمحاضرات والعلاوات وإجراءات الرقابة والتدقيق وغير ذلك.