تأسست الدراسات العليا في كلية العلوم الاسلامية /قسم الدراسات القرانية والفقه واصوله في سنة 2013-2014 وكانت خطة القبول (14)للقناة العامة و(3) على النفقة الخاصة وقد تنافس على هذه المقاعد قرابة 140 طالبا وطالبة من كل جامعات العراق , وتم قبول (17) طالبا وفق الالية المتبعة لتعليمات الوزارة , وازدادوا طالبا بالتوسعة فبلغ العدد(18) طالبا.وتمنح الكلية شهادة الماجستير بالشريعة والعلوم الاسلامية والتخصص الدقيق بحسب عنوان الرسالة .وقد حصلت الشعبة على موافقة الوزارة لفتح الدراسات العليا(الماجستير) لقسم اللغة العربية حيث تمنح شهادة في لغة القران وادابها لعام 2015-2016 والدراسات العليا في الكلية هي شعبة تابعة للسيد معاون العميد للشؤون العلمية .